分管执法稽查局、食品安全协调司、食品生产安全监督管理司、食品经营安全监督管理司、特殊食品安全监督管理司、食品安全抽检监测司、科技和财务司、机关党委。

联系机关服务中心（机关服务局）、发展研究中心、食品审评中心（国家中药品种保护审评委员会）、中国标准化研究院、中国消费者协会秘书处、中国工商出版社有限公司、中国质量标准出版传媒有限公司、中国市场监督管理学会。